2016年11月29日，股份公司召开第五届科技创新大会，明确了全公司“十三五”期间科技创新工作的总体要求和奋斗目标，部署了当前和今后一个时期企业科技创新的重点工作。每六年召开一次科技创新大会是全公司科技创新领域的盛会。 
　　六年来，公司认真落实创新驱动、转型升级战略，确立了主要领导挂帅的科技创新体制，构建了两级四层的科技创新体系。通过搭建创新平台，提升铁路建设科技创新优势，围绕高速铁路、高原铁路、重载铁路、电气化铁路开展技术创新；通过拓展创新途径，全面打造桥梁和隧道科技创新品牌，桥梁和隧道建造技术始终代表着国家队水平；通过探索创新模式，大力研发装备制造科技创新产品，在高速铁路道岔、桥梁施工装备、隧道施工专用装备研发制造方面取得突破。 
　　六年来，公司不断强化集成应用科技创新能力，拥有“高铁建造技术”、“盾构掘进技术”和“桥梁结构健康与安全”三个国家实验室和11个国家认定的企业技术中心，先后组建了桥梁、隧道、电气化、先进工程材料、检测技术、轨道和施工装备、城市轨道工程及磁悬浮交通工程等9个专业研发中心，攻克了一批“高大难新”工程建造关键核心技术，形成了一批具有自主知识产权的国内领先、世界一流科技成果。 
　　六年来，公司新获国家科技进步奖和发明奖16项，累计达到107项，其中特等奖5项、一等奖14项。新增有效专利授权4562项，其中发明专利1260项。新获中国建筑工程鲁班奖44项，累计荣获鲁班奖151项。新获中国土木工程詹天佑奖36项，累计荣获詹天佑奖101项。公司连续两个任期考核被国资委评为“科技创新优秀企业”，荣获中央企业“科技创新特别奖”，成为全国首批“创新型企业”和国资委、中国工程院创新体系建设战略研究14家试点企业之一，同时入选中央企业“十二五”科技创新战略实施纲要15家重点联系企业。2014年12月，中国中铁在国资委中央企业负责人会议上介绍了企业创新驱动发展的经验，得到社会各界的普遍赞誉。